はまりました。
atomエディタのデフォルトの設定はutf-8です。
その状態でhtmlファイルを作成してmetaタグで文字コードをsjisに指定。→文字化け。
atomのcore settingsで文字コードを編集して対処した。
だがこれだと全ファイルの文字コードを変更してしまう。
個別のファイル編集画面のfooterをよく見ると文字コードを指定できるところがあった。これを使うのが良いですね。
また、utf-8でcsvを作成してエクセルで開くと文字化けするらしい。
これはbom付きのutf-8というものを使用して対処しているとのこと。